Здесь описано по шагам, что нужно сделать, чтобы скачать
свой спектр с компьютера ЯМР и увидеть его на экране
своего компьютера.
В группе ЯМР спектры обрабатываются и записываются
на компьютерах, которые включены в Интернет-сеть,
и любой, кто имеет доступ, может использовать
спектры почти одновременно с оператором. (Если не забрать спектр
в тот же день, он будет послан в 22-00 на сервер LFMI, где будет храниться
7 дней).
1. Как забрать спектр с LFMI.
Если Вы внутри НИОХ, то СЕТЕВОЕ ОКРУЖЕНИЕ - LFMI - nmr -
имя спектрометра - код лаборатории. Если нет в папке лаборатории -
ищите в папке misc.
Взять свой спектр мышкой и переташить в ПРОВОДНИК.
(Если Вы вне НИОХ или СЕТЕВОЕ ОКРУЖЕНИЕ не работает
- см. ***)
2. Как забрать спектр ЯМР с AC-200 и AM-400 лаборатории ФМИ.
Для этого нужно установить на своем компьютере программу
ADADIR.
Она находится на ftp.nioch.nsc.ru/private/nmr/
Программу нужно раззиповать и положить в директорию ADADIR.
Далее - зайти в СЕТЕВОЕ ОКРУЖЕНИЕ, выбрать нужный спектрометр:
ac-200, am-400, открыть папку adakos, выбрать файл
d4.cdc с AC-200 и AM-400, щелкнуть 2 раза,
при этом либо сразу откроется adadir, либо окошко ОТКРЫТЬ С ПОМОЩЬЮ,
нажать кнопку ДРУГОЕ, найти adadir.
В окне adadir выбрать (FILE-Change Data Dir) на второй панели
папку
на своем компьютере, куда будут складываться спектры,
скопировать нужный спектр (F4-GET BINARY).
2а. Как забрать спектр ЯМР с Av-300 и DRX-500 лаборатории ФМИ.
Чтобы забрать спектры с DRX500, Av300 в день записи спектра, зайдите
по Сетевому окружению и
возьмите спектр из папки D4. Здесь спектры хранятся в виде вложенных
папок.
В 13-00 и 22-00 спектры зипуются и посылаются на сервер lfmi.
3. Как его увидеть и обработать.
Любая программа обработки спектров ЯМР включает в себя обязательные
шаги:
вызов файла со спектром, (для C13 LB=1, EM) фурье-преобразование FT
(если это
спад свободной индукции), правка фазы (обычно можно воспользоваться
автоматической правкой фазы). Далее более очевидные действия с помощью
кнопок на экране и на мышке. Результат, полученный на экране, можно
перенести на модуль печати, который также позволяет редактировать изображение.
И, наконец, все это можно распечатать.
Известные программы обработки спектров ЯМР (которые работают
на РС)
- WINNMR1d, NUTS, SPINWORKS, ХWINNMR, TOP-SPIN.
4. Самая простая программа - SPINWORKS.
(В дистрибутиве есть док файл с описанием работы SPINWORKS.)
Скачать, установить, запустить.
Далее Options - Data format:
DISNMR для AC-200 и AM-400
UXNMR для DRX500, Av300.
File-Open- найти спектр на Вашем диске (ранее перенесенный -
см. выше)
для AC-200 и AM-400 просто выбрать имя файла - open
для Av-300 и DRX-500 открыть папки, найти FID - open
Processing для Н1 - ft,
для С13 LB=1, EM, FT, далее фаза, итегрирование и тд.
5.Здесь дается описание работы с WINNMR1d, пока краткое.
Включить WINNMR1d. FILE-OPEN, найти спектр на диске. На экране
появится спад свободной индукции. FT ! - ДА, появится спектр.
(для DRX500, Av300 открыть папки, найти FID,
либо зайти в PDATA, найти 1r - готовый спектр!)
Если спектр кривой, PROCESS - Autom.Phase Correction.
Если спектр все еще кривой, ручная правка фазы, PROCESS - Phase Correction,
в новом окошке на наибольшем сигнале править - Zero Order,
затем на наиболее удаленном от наибольшего - First Order. Return.
Растяжка и смещение спектра: нажимая на кнопки <> и ><,
растягивать и
сжимать спектр, а смещая внизу спектра Scroll Bar, смещать участок
спектра.
*2, .2 - изменять высоту.
Следующая важная операция - калибровка сдвига. Вывести на экран
сигнал с известным сдвигом, нажать на кнопку со стрелкой ВВЕРХ,
нажать мышку на нужный сигнал. На верхней рамке экрана выводится сдвиг
(х)
и высота сигнала (у). Если сдвиг сигнала отличается от нужного,
выбрать меню Analysis - Calibration , в новом окне Calibration ,
в окошечке выставить Х= нужный сдвиг, ОК, Return.
Измерение констант ССВ (J).
Кнопка со стрелкой ВВЕРХ - устанавливает курсор точно на вершину
ближайшего сигнала. Кнопка со стрелкой ВНИЗ - в любое место спектра.
Для измерения расстояния между линиями: Analysis - Distance,
Options - выставить Distance lines =2, ОК, установить курсор на одну
из линий,
нажать Mouse Grid, подвести мышку ко второй линии,
сосчитать J на верхней рамке экрана.
Если получилось много окон или попали неизвестно куда - WINDOWS-SPECTRUM.
Хорошо бы почитать HELP.
Получив на экране что-то полезное, нажать PREVIEW (окно печати).
Здесь также можно модифицировать изображение. PRINT - печать!
Надеюсь, этого будет достаточно для того, чтобы скачать
и увидеть спектр, далее, проявив настойчивость и фантазию,
самостоятельно расписывать спектры.
.
Web Master M.M. Shakirov, 2001-2005 [email protected]